Welke phpMyAdmin wordt gebruikt, hangt af van wat er is geïnstalleerd:
Dit kan handig zijn als u één gedeelde phpMyAdmin-instantie wilt (bijvoorbeeld onder een eigen hostnaam zoals pma.example.tld ), maar toch installaties per virtuele server wilt kunnen uitvoeren wanneer dat nodig is.
Let op: gebruik een gedeelde "systeemstandaard" phpMyAdmin onder een dedicated hostnaam alleen als u de virtuele server waarop deze draait volledig vertrouwt. Wanneer andere virtuele servers geen eigen phpMyAdmin hebben geïnstalleerd, gebruiken ze deze standaardinstantie. Dit kan betekenen dat hun MySQL-inloggegevens worden doorgegeven voor het inloggen. Als de hostende virtuele server gecompromitteerd, verkeerd geconfigureerd of beheerd wordt door iemand die u niet volledig vertrouwt, kunnen deze inloggegevens openbaar worden gemaakt.